AMPureXPもどきの変更点

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{{category 実験プロトコル}}
*AMPureXPもどきの調製
　PCR産物などのDNAの精製、サイズ選択や濃度調整に多用するAMPureXPと同様に使用できる磁気ビーズ溶液の作成方法。Serapureとも呼ばれる。ゲノムDNA抽出にも使用できる。出典は[Rohland and Reich (2012)|http://dx.doi.org/10.1101/gr.128124.111]とそのサプリ。
*必要なもの
-50mL遠沈管 1本
-1.5mLチューブ 1本
-Sera-Mag SpeedBeads Carboxylate-Modified Magnetic Particles (Hydrophobic) 1mL
-Sera-Mag SpeedBeads Carboxylate-Modified Magnetic Particles (Hydrophobic) 65152105050250 1mL
-TE 3mL
-PEG8000 9g
-NaCl 2.92g
-1M Tris-HCl pH8.0 500uL
-0.5M EDTA pH8.0 100uL
-Tween-20 27.5uL
-SPW 適量

*手順
+1.5mLチューブによく転倒混和したSera-Mag SpeedBeadsを1mL取る
+マグネットスタンドに立てて5分待つ
+上澄みをチップで吸い取って捨てる
+TE 1mLを加えてマグネットスタンドから外し、よく転倒混和する
+マグネットスタンドに立てて5分待つ
+上澄みをチップで吸い取って捨てる
+TE 1mLを加えてマグネットスタンドから外し、よく転倒混和する
+マグネットスタンドに立てて5分待つ
+上澄みをチップで吸い取って捨てる
+TE 1mLを加えてマグネットスタンドから外し、よく転倒混和する
+50mL遠沈管にPEG8000 9gとNaCl 2.92gを入れる
+1M Tris-HCl pH8.0 500uLと0.5M EDTA pH8.0 100uLを加える
+SPWで45mLまでメスアップしてPEGを完全に溶かす
+Tween-20 27.5uLと10の溶液1mLを加える
+SPWで50mLまでメスアップする