系統解析のための色々
- 2地点の緯度・経度から距離を計算する
- GenBank形式配列から特定遺伝子を切り出す
- Illumina用アダプター付きプライマー
- Illumina用インデックス付きプライマー
- Non-InterleavedなPHYLIPファイルを作る
- ZaurusでEMBOSS
- ZaurusでStaden Package
- phredによるベースコール
- アライメントのコツ
- タンパクコード領域塩基配列のマルチプルアライメント
- メルセンヌツイスターによる乱数でブートストラップリサンプリング
- ユニバーサルプライマー
- 塩基配列からアミノ酸配列への翻訳
- 核酸・アミノ酸配列ファイル形式の変換
- 系統樹上のOTU間距離を求める
- 同樹形・不等枝長の複数系統樹から平均枝長の系統樹を作成する