{{category 実験プロトコル}} *DNAアガロースゲル電気泳動  PCR産物を1〜2%アガロースゲル内で電気泳動することにより、鎖長ごとに分離する(長いほどアガロース内の移動速度が落ちる)。ゲル切りを行ってDNAを回収することも可能。ただしその際は紫外線を当てすぎないように注意。 *必要なもの -適当なチューブ 1本以上 or パラフィルム -アガロース 適量 -1x TAE 20〜80ml -1,000x SYBR Gold or SYBR Safe DMSO溶液 10〜40ul + 1x TAE 適量 -PCR産物 2ul -1.5x loading dye 4ul /sample+マーカー -ラダーマーカー 2ul *手順 +ビンにアガロース 適量と1x TAEを必要量の1/2強入れて電子レンジで加熱 +アガロースが溶けたら残りの1x TAEを加えて混ぜ、型に流し込む +PCR産物をスピンダウン +1.5x loading dye 4ul x(サンプル数+1)にPCR産物 2ulを加える +固まったゲルを泳動槽にセット +4とラダーマーカーをゲルの穴にapply +泳動槽のふたをきっちり閉めてから極性方向に注意して電源ON (電極付近から気泡が発生しているかよく確認すること) +適当な時間電気泳動を行う +ゲル型に1x TAE 適量(ゲル作成に要した量の半分)を入れ1,000x SYBR Gold or SYBR Safe DMSO溶液を1xになるよう混合 (SYBR Safeの希釈済TAE溶液の場合はそのまま使う) +ゲルをゲルトレイから外して9に漬け込む +アルミホイルを被せて1時間以上放置(時々揺すると良い) +トランスイルミネータでUVか青色光を当てて泳動像を確認  SYBR Safeの場合は1xになるようにゲルに混合してしまってもよい(これをプレキャストとかプレステインと呼ぶ)。SYBR Goldではプレキャストすると泳動像が乱れてしまうのでできない。