{{category 実験プロトコル}} *PCR  ポリメラーゼ連鎖反応法を利用して特定の範囲のDNAのみを増幅させる。反応に利用するポリメラーゼは高価で、常温以上でどんどん劣化するので十分に注意する。ここでは''Taq'' DNAポリメラーゼを用いた典型的な場合を記す。 *必要なもの -適当なチューブ 1本 -600ulチューブ 1本 or 8連チューブ 1/8本 /sample -10x PCR Buffer 2ul /sample -10mM(2.5mM each) dNTPs Mixture 2ul /sample -5〜10uM Primer 2ul x2 /sample -ミリQ 10.8ul /sample -''Taq'' DNAポリメラーゼ 0.2ul /sample -鋳型DNA水溶液 1ul *手順 +使用するチューブが入るチューブ立てを冷凍庫に入れておくか、熱伝導性の高い鉄製チューブ立てを用意しておく +チューブに10x PCR Buffer 2ul、10mM(2.5mM each) dNTPs Mixture 2ul、5〜10uM Primer 2ul x2、ミリQ 10.8ulをサンプル数+2(ネガコン+マージン)だけ入れる +使用するチューブに鋳型DNA水溶液を1ul(ネガコンではSPW 1ul)入れておく (あらかじめ薄くしておいてピペットで取りやすい量入れてもよい。ただし1でSPWを減らすこと) +2を氷上に移して''Taq'' 0.2ulをサンプル数+2倍加える +3を1のチューブ立て(鉄製チューブ立ては氷冷)に移して4を19ulずつ加える +必要ならミネラルオイルを一滴加える +サーマルサイクラーにセットしてPCR +アガロースゲル電気泳動でスクリーニング  ''Taq''はTaKaRaのEx-TaqでもNEBの激安Taqでも濃度は同じなので全く同じプロトコルでよい。コスト削減のため液量をさらに減らすことを推奨。ただし10ul未満は失敗する可能性が高まるので非推奨。PCRのプログラムはアニーリング温度に注意。非特異的増幅を減らすには''Taq''を加える段階からは全て氷上で作業する(チューブ立てを冷凍庫で冷やすのはその代用)、徐々にアニーリング温度を下げていくStep Downサイクルなどプログラムを工夫する、AppliedBiosystemsのAmpliTaq GoldなどのHotStart用ポリメラーゼを使う、などの対処を取る。