{{category 生態学会}} *メタバーコーディング・環境DNAバーコーディング解析の技法 このページは日本生態学会2016年年次大会の自由集会『メタバーコーディング・環境DNAバーコーディング解析の技法』のページです。 *企画 -田辺晶史 (水研セ・中央水研) *日時 2016年03月24日 17:00-19:00 *会場 仙台国際センター会議棟2F桜2(Room D) *概要 環境DNAやメタゲノムを用いたDNAバーコーディング法は、様々な環境での生物群集の情報をより省エネルギー・省コストで得られる技術として期待されており、特に微生物生態学の分野では多くの応用例が蓄積されている。大型生物を対象とする研究では、水生生物が水中に放出しているDNA=環境DNAを検出可能であることが実証され、今後応用が進むものと思われる。陸上生物であっても、すり潰してDNAを抽出するか、液体に溶いてからDNAを抽出することで同様の処理が可能である。この技術を応用することで、より多くの地点の群集を観測したり、より短い間隔で観測を行ったり、より網羅的な観測を行うことが可能になるが、サンプルの採集・DNA抽出・シーケンスは言うに及ばず、シーケンスデータから群集行列データへの変換、群集行列データの統計的分析にはこれまでとは異なる様々な落とし穴が存在し、新規参入のハードルとなっている。本集会では、それぞれの分析過程のテクニカルな解説を経験者や開発者が行い、落とし穴の回避方法や今後の課題と展望について議論する。 *演題 +趣旨説明 田辺晶史 (水研セ・中央水研) +MiSeqを用いた超多検体分析:サンプリングからシーケンスまで 東樹宏和 (京大・人環) --共立出版の書籍『[DNA情報で生態系を読み解く|http://www.kyoritsu-pub.co.jp/bookdetail/9784320057531]』を参照 +NGSデータからの超大規模群集行列データの作成 田辺晶史 (水研セ・中央水研) --無償公開チュートリアルテキスト『[生態学のためのメタバーコーディングとDNAバーコーディング|http://www.fifthdimension.jp/documents/metabarcodingtextbook/]』を参照 +メタゲノムデータを用いた群集統計解析法:レアファクションから仮説検定まで 門脇浩明 (京大・人環) --大会後に参考資料をアップロードします