{{category 系統解析のための色々}}

*Illumina用アダプター付きプライマー
　Illuminaのシーケンサでマルチプレックスする場合、アダプター付きプライマーでPCRを行うことで、PCR産物にアダプターを付加する。また、シーケンス時に最初の6塩基の多様性が高くなるように、Nを6塩基加える。さらに、それ以降の塩基の多様度も高くなるよう、Nを3塩基にしたものと6塩基にしたものを混合して使用する。

*アダプター配列
-F TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGNNNNNN
-R GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGNNNNNN

*作成例
-F Euk1391f-3N TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGNNNGTACACACCGCCCGTC
-F Euk1391f-6N TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGNNNHVBGTACACACCGCCCGTC
-R EukBr-3N GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGNNNTGATCCTTCTGCAGGTTCACCTAC
-R EukBr-6N GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGNNNVHBTGATCCTTCTGCAGGTTCACCTAC
-F jgLCO1490-3N TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGNNNTITCIACIAAYCAYAARGAYATTGG
-F jgLCO1490-6N TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGNNNVNVTITCIACIAAYCAYAARGAYATTGG
-R mlCOIintR-3N GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGNNNGGRGGRTASACSGTTCASCCSGTSCC
-R mlCOIintR-6N GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGNNNHHYGGRGGRTASACSGTTCASCCSGTSCC
-F mlCOIintF-3N TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGNNNGGWACWGGWTGAACWGTWTAYCCYCC
-F mlCOIintF-6N TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGNNNHHSGGWACWGGWTGAACWGTWTAYCCYCC
-R jgHCO2198-3N GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGNNNTAIACYTCIGGRTGICCRAARAAYCA
-R jgHCO2198-6N GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGNNNVBNTAIACYTCIGGRTGICCRAARAAYCA
-F MiFish-U-F-3N TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGNNNGTCGGTAAAACTCGTGCCAGC
-F MiFish-U-F-6N TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGNNNHVDGTCGGTAAAACTCGTGCCAGC
-R MiFish-U-R-3N GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGNNNCATAGTGGGGTATCTAATCCCAGTTTG
-R MiFish-U-R-6N GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGNNNDBVCATAGTGGGGTATCTAATCCCAGTTTG
-F MiFish-E-F-3N TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGNNNGTTGGTAAATCTCGTGCCAGC
-F MiFish-E-F-6N TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGNNNHVVGTTGGTAAATCTCGTGCCAGC
-R MiFish-E-R-3N GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGNNNCATAGTGGGGTATCTAATCCTAGTTTG
-R MiFish-E-R-6N GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGNNNDBVCATAGTGGGGTATCTAATCCTAGTTTG