*[NIH Image|http://rsb.info.nih.gov/nih-image/]

Mac用の画像解析プログラム。マクロ機能が強力。

*[ScionImage|http://www.scioncorp.com/]

NIH ImageのWindows移植版。

*[ImageJ|http://rsb.info.nih.gov/ij/]

NIH ImageのJava版みたいなもの。Macro機能だけでなくPluginアーキテクチャを採用しており、Pluginを用いた機能拡張が可能。

*[Shape|http://cse.naro.affrc.go.jp/iwatah/shape/index.html]

中央農研の岩田さんが開発されている形態解析プログラム。形態のシェイプ成分から楕円フーリエ記述子を抽出して主成分分析を行う。Windows用。R上で動作する[Shape on R|http://cse.naro.affrc.go.jp/iwatah/shape_r/index.html]もある。

*[SB morphometrics|http://life.bio.sunysb.edu/morph/]

有用な形態測定・解析ソフトウェアがある。